LABORATORIO CLÍNICO EN MICROBIOLOGÍA

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Módulo 1: Fundamentos y Bioseguridad en el Laboratorio de Microbiología Clínica

Objetivo del Módulo:Establecer las bases conceptuales de la microbiología, la estructura del laboratorio clínico y, principalmente, dominar las normas de bioseguridad y bioprotección para garantizar un entorno de trabajo seguro para el personal, la comunidad y el medio ambiente.

• Capítulo 1.1: Introducción a la Microbiología Clínica

  • Tema 1.1.1: Historia y relevancia de la microbiología en la medicina.

  • Tema 1.1.2: El rol del microbiólogo clínico en el equipo de salud.

  • Tema 1.1.3: Estructura y organización de un laboratorio de microbiología moderno.

• Capítulo 1.2: Bioseguridad y Bioprotección

  • Tema 1.2.1: Principios de bioseguridad: evaluación y gestión de riesgos biológicos.

  • Tema 1.2.2: Niveles de Contención Biológica (BSL-1, BSL-2, BSL-3).

  • Tema 1.2.3: Equipos de protección personal (EPP) y cabinas de seguridad biológica (CSB).

• Capítulo 1.3: Taxonomía y Estructura Microbiana

  • Tema 1.3.1: Clasificación y nomenclatura: de fenotipo a genotipo.

  • Tema 1.3.2: Estructura y función de la célula procariota (bacterias).

  • Tema 1.3.3: Estructura general de virus, hongos y parásitos de importancia clínica.

• Capítulo 1.4: Fisiología y Genética Bacteriana

  • Tema 1.4.1: Metabolismo y requerimientos nutricionales.

  • Tema 1.4.2: Curva de crecimiento bacteriano y factores que la afectan.

  • Tema 1.4.3: Mecanismos de transferencia genética: conjugación, transformación y transducción.

Módulo 2: Técnicas Microbiológicas Esenciales

Objetivo del Módulo:Desarrollar destrezas prácticas en el manejo de muestras, la observación microscópica y el cultivo de microorganismos, que constituyen los pilares del diagnóstico microbiológico tradicional.

• Capítulo 2.1: Fase Pre-analítica: Recolección y Procesamiento de Muestras

  • Tema 2.1.1: Importancia de la fase preanalítica en el resultado final.

  • Tema 2.1.2: Tipos de muestras clínicas: criterios de obtención, transporte y conservación.

  • Tema 2.1.3: Criterios de aceptación y rechazo de muestras en el laboratorio.

• Capítulo 2.2: Microscopía y Tinciones Fundamentales

  • Tema 2.2.1: Fundamentos y manejo del microscopio óptico.

  • Tema 2.2.2: La tinción de Gram: procedimiento, interpretación y control de calidad.

  • Tema 2.2.3: Tinciones especiales: Ziehl-Neelsen, tinta china, azul de lactofen

• Capítulo 2.3: Medios de Cultivo

  • Tema 2.3.1: Clasificación de los medios de cultivo: nutritivos, de enriquecimiento, selectivos y diferenciales.

  • Tema 2.3.2: Preparación, esterilización y control de calidad de medios de cultivo.

  • Tema 2.3.3: Aplicación de los principales medios: Agar Sangre, Agar Chocolate, Agar MacConkey.

• Capítulo 2.4: Técnicas de Siembra y Aislamiento

  • Tema 2.4.1: Métodos de siembra para aislamiento por estría en placa.

  • Tema 2.4.2: Técnicas de siembra para recuento de colonias (muestras de orina).

  • Tema 2.4.3: Condiciones de incubación: temperatura, atmósfera (aerobiosis, anaerobiosis, microaerofilia).

Módulo 3: Bacteriología I: Cocos Gram Positivos

Objetivo del Módulo:Identificar y diferenciar los principales cocos Gram positivos de importancia clínica, comprendiendo su patogenia y los métodos de laboratorio para su diagnóstico preciso.

• Capítulo 3.1: GéneroEstafilococoy relacionados

  • Tema 3.1.1:Estafilococo áureo: pruebas clave (coagulasa, DNasa) y factores de virulencia.

  • Tema 3.1.2: Estafilococos coagulasa-negativos (ECN): identificación y significancia clínica.

  • Tema 3.1.3: Detección deEstafilococo áureoResistente al metilo (SARM).

• Capítulo 3.2: GéneroEstreptococo

  • Tema 3.2.1: Clasificación de los estreptococos: hemólisis y grupos de Lancefield.

  • Tema 3.2.2:Estreptococo pyogenes(Grupo A): diagnóstico y pruebas de identificación.

  • Tema 3.2.3:Estreptococo agalactiae(Grupo B): importancia en neonatos y tamizaje en gestantes.

• Capítulo 3.3:Streptococcus pneumoniaey Grupoviridans

  • Tema 3.3.1: Identificación deS. pneumoniae: sensibilidad a la optoquina y solubilidad en bilis.

  • Tema 3.3.2: Estreptococos del grupoviridans: rol en endocarditis y su diferenciación.

  • Tema 3.3.3: Detección de resistencia a penicilina enS. pneumoniae.

• Capítulo 3.4: GéneroEnterococoy otros cocos Gram positivos

  • Tema 3.4.1: Identificación deEnterococospp.: prueba de PYR y tolerancia a ventas.

  • Tema 3.4.2: Importancia de la resistencia a vancomicina enEnterococo(ERV).

  • Tema 3.4.3: Otros cocos Gram positivos de menor frecuencia (Aerococo,Gemella).

Módulo 4: Bacteriología II: Enterobacterales

Objetivo del Módulo:Dominar la identificación de la familia Enterobacterales (antes Enterobacteriaceae), el grupo más común de bacilos Gram negativos aislados en el laboratorio, utilizando pruebas bioquímicas y sistemas automatizados.

• Capítulo 4.1: Características Generales y Pruebas Bioquímicas Primarias

  • Tema 4.1.1: Propiedades generales de la familia Enterobacterales.

  • Tema 4.1.2: Pruebas de Oxidasa y su importancia en la diferenciación inicial.

  • Tema 4.1.3: Interpretación de medios primarios: Agar MacConkey, EMB, XLD.

• Capítulo 4.2: Identificación de Patógenos Intestinales

  • Tema 4.2.1: Diagnóstico deSalmonelaspp. yShigellaespecies

  • Tema 4.2.2:Escherichia colipatógenas: serotipificación y diagnóstico de E. coli O157:H7.

  • Tema 4.2.3: Identificación deYersinia enterocolíticay su cultivo en frío.

• Capítulo 4.3: Patógenos Oportunistas Comunes

  • Tema 4.3.1: Identificación deEscherichia colien infecciones extraintestinales (UIT, bacteriemia).

  • Tema 4.3.2: GénerosKlebsiella,Enterobacterias,SerratiayCitrobacteria.

  • Tema 4.3.3: GrupoProteo,ProvidenciayMorganella: caracterización y prueba de ureasa.

• Capítulo 4.4: Sistemas de Identificación y Serotipificación

  • Tema 4.4.1: Uso de galerías bioquímicas manuales (API 20E).

  • Tema 4.4.2: Fundamentos de sistemas automatizados de identificación (VITEK®, MicroScan®).

  • Tema 4.4.3: Principios y aplicaciones de la serotipificación (antígenos O, H, K).

Módulo 5: Bacteriología III: Bacilos Gram Negativos No Fermentadores y Fastidiosos

Objetivo del Módulo:Identificar los bacilos Gram negativos no fermentadores de glucosa y aquellos con requerimientos nutricionales especiales (fastidiosos), reconociendo su importancia en infecciones nosocomiales y específicas.

• Capítulo 5.1: Bacilos Gram Negativos No Fermentadores (BGNNF)

  • Tema 5.1.1: Características generales y diferenciación de los Enterobacterales.

  • Tema 5.1.2:Pseudomonas aeruginosa: identificación (olor, pigmentos) y relevancia clínica.

  • Tema 5.1.3: ComplejoAcinetobacter baumannii: un patógeno nosocomial multirresistente.

• Capítulo 5.2: Otros BGNNF de Importancia Clínica

  • Tema 5.2.1: ComplejoBurkholderia cepacia: riesgo en pacientes con fibrosis química.

  • Tema 5.2.2:Stenotrophomonas maltophilia: resistencia intrínseca y opciones terapéuticas.

  • Tema 5.2.3: Otros no fermentadores:Criseobacteria,Elizabethkingi

• Capítulo 5.3: GéneroHaemophilus

  • Tema 5.3.1: Requerimientos nutricionales: factores X y V y el fenómeno de satelitismo.

  • Tema 5.3.2: Identificación deHaemophilus influenzaey su serotipificación (tipo b).

  • Tema 5.3.3: Detección de producción de beta-lactamasas enHaemophilus.

• Capítulo 5.4: Cocobacilos y Cocos Gram Negativos Fastidiosos

  • Tema 5.4.1: GéneroNeisseria:N. gonorrhoeaevs.N. meningitidis.

  • Tema 5.4.2: Aislamiento e identificación deMoraxella catarrhalis.

  • Tema 5.4.3: Otros patógenos fastidiosos: Grupo HACEK,Pasteurella,Bordetella.

Módulo 6: Bacteriología IV: Anaerobios, Espiroquetas y Bacterias Intracelulares

Objetivo del Módulo:Comprender las técnicas especiales requeridas para el cultivo e identificación de bacterias anaerobias y familiarizarse con los métodos de diagnóstico (mayoritariamente indirectos) para espiroquetas y bacterias intracelulares.

• Capítulo 6.1: Bacterias Anaerobias Estrictas

  • Tema 6.1.1: Recolección y transporte adecuado de muestras para anaerobios.

  • Tema 6.1.2: Técnicas de cultivo: jarras de anaerobiosis, cámaras y medios especiales.

  • Tema 6.1.3: Identificación presuntiva y definitiva deClostridium,Bacteroides, etc.

• Capítulo 6.2:Clostridioides difficiley Bacilos Gram Positivos Esporulados

  • Tema 6.2.1: Diagnóstico de la infección porC. difficile: detección de toxinas vs. cultivo.

  • Tema 6.2.2:Clostridium perfringensy la gangrena gaseosa.

  • Tema 6.2.3: GéneroBacilo:B. anthracisvs.B. cereus.

• Capítulo 6.3: Espiroquetas de Importancia Médica

  • Tema 6.3.1:Treponema pallidum: diagnóstico serológico de la sífilis (pruebas treponémicas y no treponémicas).

  • Tema 6.3.2:Borrelia burgdorferiy la enfermedad de Lyme: diagnóstico serológico y molecular.

  • Tema 6.3.3:Leptospira: diagnóstico por cultivo y serología.

• Capítulo 6.4: Bacterias Intracelulares y Atípicas

  • Tema 6.4.1: Diagnóstico deChlamydia trachomatisyChlamydophila pneumoniae.

  • Tema 6.4.2: GéneroMicoplasmayUreaplasma: cultivo y diagnóstico molecular.

  • Tema 6.4.3: Diagnóstico de Rickettsiosis y otras fiebres manchadas.

Módulo 7: Pruebas de Sensibilidad a los Antimicrobianos (PSA)

Objetivo del Módulo:Dominar los fundamentos y la ejecución de las pruebas de sensibilidad antimicrobiana (antibiograma), así como la interpretación de resultados y la detección de mecanismos de resistencia fenotípicos clave según estándares internacionales (CLSI/EUCAST).

• Capítulo 7.1: Fundamentos de la Acción Antimicrobiana

  • Tema 7.1.1: Mecanismos de acción de los principales grupos de antibióticos.

  • Tema 7.1.2: Conceptos de Concentración Mínima Inhibitoria (CMI) y Bactericida (CMB).

  • Tema 7.1.3: Estándares internacionales: CLSI y EUCAST, diferencias y armonización.

• Capítulo 7.2: Métodos de Difusión en Disco (Kirby-Bauer)

  • Tema 7.2.1: Procedimiento estandarizado: preparación del inóculo, siembra y aplicación de discos.

  • Tema 7.2.2: Lectura e interpretación de los halos de inhibición y puntos de corte.

  • Tema 7.2.3: Control de calidad con cepas ATCC.

• Capítulo 7.3: Métodos de Dilución y Gradiente

  • Tema 7.3.1: Microdilución en caldo para la determinación de la CMI.

  • Tema 7.3.2: Tiras de gradiente (E-test®): principio y aplicación clínica.

  • Tema 7.3.3: Ventajas y desventajas de los métodos de dilución frente a la difusión.

• Capítulo 7.4: Detección Fenotípica de Mecanismos de Resistencia

  • Tema 7.4.1: Detección de Beta-Lactamasas de Espectro Extendido (BLEE).

  • Tema 7.4.2: Detección de Carbapenemasas (Test de Hodge modificado, mCIM, Carba NP).

  • Tema 7.4.3: Detección de resistencia inducible a clindamicina (D-test) en estafilococos.

Módulo 8: Micología Clínica

Objetivo del Módulo:Adquirir las competencias para aislar, identificar y estudiar los hongos (levaduras y mohos) causantes de micosis superficiales, subcutáneas y sistémicas.

• Capítulo 8.1: Fundamentos de Micología y Diagnóstico Micológico

  • Tema 8.1.1: Estructura y clasificación de los hongos de importancia médica.

  • Tema 8.1.2: Toma de muestra y procesamiento para diagnóstico micológico.

  • Tema 8.1.3: Examen directo: preparación con KOH, tinción de Gram, tinta china.

• Capítulo 8.2: Levaduras de Importancia Clínica

  • Tema 8.2.1: Identificación deCandida albicans(tubo germinal, cultivo en CHROMagar).

  • Tema 8.2.2: Identificación de especies deCandidaNo-albicansy su perfil de resistencia.

  • Tema 8.2.3:Cryptococcus neoformans: diagnóstico microscópico, cultivo y detección de antígeno.

• Capítulo 8.3: Mohos Hialinos y Dematiáceos

  • Tema 8.3.1: Aislamiento e identificación deAspergiloespecies

  • Tema 8.3.2: Zigomicetos (Mucorales) y la mucormicosis.

  • Tema 8.3.3: Mohos dematiáceos (hongos negros) y feohifomicosis.

• Capítulo 8.4: Hongos Dimórficos y Pruebas de Sensibilidad Antifúngica

  • Tema 8.4.1: Bioseguridad en el manejo de hongos dimórficos (Histoplasma, Coccidioides).

  • Tema 8.4.2: Diagnóstico de las micosis endémicas.

  • Tema 8.4.3: Fundamentos y métodos para el antifungigrama (AFST).

Módulo 9: Micobacteriología Clínica

Objetivo del Módulo:Dominar las técnicas de bioseguridad, procesamiento, cultivo e identificación del Complejo.Mycobacterium tuberculosisy otras micobacterias no tuberculosas (MNT), incluyendo métodos rápidos y moleculares.

• Capítulo 9.1: Bioseguridad y Procesamiento de Muestras para Micobacterias

  • Tema 9.1.1: Bioseguridad en el laboratorio de micobacteriología (BSL-3).

  • Tema 9.1.2: Tipos de muestras para la investigación de micobacterias.

  • Tema 9.1.3: Métodos de descontaminación y concentración de muestras (método de NALC-NaOH).

• Capítulo 9.2: Baciloscopia y Cultivo

  • Tema 9.2.1: Tinción de Ziehl-Neelsen y Auramina-Rodamina.

  • Tema 9.2.2: Medios de cultivo sólidos (Löwenstein-Jensen) y líquidos (MGIT).

  • Tema 9.2.3: Sistemas automatizados de detección de crecimiento.

• Capítulo 9.3: Identificación y Pruebas de Sensibilidad

  • Tema 9.3.1: Pruebas bioquímicas para la identificación del complejoM. tuberculosis.

  • Tema 9.3.2: Métodos de PSA para fármacos de primera y segunda línea.

  • Tema 9.3.3: Identificación de Micobacterias No Tuberculosas (MNT).

• Capítulo 9.4: Diagnóstico Molecular en Micobacteriología

  • Tema 9.4.1: Sondas de ADN y PCR en tiempo real (ej. GeneXpert MTB/RIF).

  • Tema 9.4.2: Line Probe Assays (LPA) para detección de resistencia.

  • Tema 9.4.3: Aplicaciones de la secuenciación en el diagnóstico de la tuberculosis.

Módulo 10: Parasitología Clínica

Objetivo del Módulo:Desarrollar la habilidad de identificar los principales parásitos (protozoos y helmintos) que afectan al ser humano a través del análisis de muestras fecales, sanguíneas y de otros fluidos corporales.

• Capítulo 10.1: Coproparasitología: Protozoos Intestinales

  • Tema 10.1.1: Recolección y conservación de muestras fecales.

  • Tema 10.1.2: Examen macroscópico y microscópico en fresco (solución salina y Lugol).

  • Tema 10.1.3: Identificación de trofozoítos y quistes de amebas, flagelados y ciliados.

• Capítulo 10.2: Coproparasitología: Helmintos Intestinales

  • Tema 10.2.1: Identificación de huevos y larvas de nematodos (áscaris, uncinarias, tricocéfalos).

  • Tema 10.2.2: Identificación de huevos y proglótides de cestodos (Taenia,Hymenolepis).

  • Tema 10.2.3: Métodos de concentración (flotación y sedimentación).

• Capítulo 10.3: Parásitos Sanguíneos y Tisulares

  • Tema 10.3.1: Diagnóstico de Malaria: frotis de gota fina y gota gruesa, identificación de especies dePlasmodio.

  • Tema 10.3.2: Diagnóstico de la enfermedad de Chagas (Trypanosoma cruzi).

  • Tema 10.3.3: Diagnóstico de Leishmaniasis y Toxoplasmosis.

• Capítulo 10.4: Técnicas Especiales e Inmunodiagnóstico

  • Tema 10.4.1: Tinciones permanentes para parásitos intestinales (Tricrómica, Hematoxilina férrica).

  • Tema 10.4.2: Detección de antígenos en heces (Giardia,Criptosporidio,Entamoeba histolytica).

  • Tema 10.4.3: Fundamentos del serodiagnóstico en parasitología.

Módulo 11: Virología Clínica

Objetivo del Módulo:Comprender los principios del diagnóstico virológico, desde los métodos tradicionales hasta las técnicas moleculares y serológicas que son el estándar actual para la detección de infecciones virales.

• Capítulo 11.1: Fundamentos del Diagnóstico Virológico

  • Tema 11.1.1: Estructura y clasificación de los virus de importancia clínica.

  • Tema 11.1.2: Toma y transporte de muestras para virología.

  • Tema 11.1.3: Métodos de diagnóstico directo vs indirecto.

• Capítulo 11.2: Métodos Tradicionales y Detección de Antígenos

  • Tema 11.2.1: Cultivo celular y observación del efecto citopático (ECP).

  • Tema 11.2.2: Inmunofluorescencia (directa e indirecta) para detección viral.

  • Tema 11.2.3: Enzimoinmunoanálisis (ELISA) para detección de antígenos virales (VRS, Rotavirus).

• Capítulo 11.3: Diagnóstico Serológico de Infecciones Virales

  • Tema 11.3.1: Detección de anticuerpos IgM e IgG: interpretación de perfiles serológicos.

  • Tema 11.3.2: Diagnóstico serológico de VIH, Hepatitis B y C.

  • Tema 11.3.3: Serología para el complejo TORCH (Toxoplasma, Otros, Rubeola, Citomegalovirus, Herpes).

• Capítulo 11.4: Diagnóstico Molecular en Virología

  • Tema 11.4.1: Fundamentos de la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) en virología.

  • Tema 11.4.2: PCR en tiempo real (qPCR) para cuantificación de carga viral (VIH, VHB, VHC).

  • Tema 11.4.3: Paneles sindrómicos moleculares para patógenos respiratorios y gastrointestinales.

Módulo 12: Gestión de Calidad, Automatización y Futuro de la Microbiología

Objetivo del Módulo:Integrar todos los conocimientos adquiridos dentro de un marco de gestión de la calidad, explorar el impacto de la automatización y las nuevas tecnologías (como la espectrometría de masas y la secuenciación) en el laboratorio, y comprender el rol del microbiólogo en la epidemiología y la vigilancia.

• Capítulo 12.1: Sistema de Gestión de la Calidad (SGC) en Microbiología

  • Tema 12.1.1: Control de calidad interno y externo (programas de evaluación externa de la calidad).

  • Tema 12.1.2: Acreditación de laboratorios bajo la norma ISO 15189.

  • Tema 12.1.3: Gestión de documentos, registros y no conformidades.

• Capítulo 12.2: Automatización e Informática en el Laboratorio

  • Tema 12.2.1: Sistemas automatizados de hemocultivos.

  • Tema 12.2.2: Sistemas integrados de identificación y antibiograma.

  • Tema 12.2.3: El Sistema de Información del Laboratorio (LIS) y la validación de resultados

• Capítulo 12.3: Tecnologías Emergentes en el Diagnóstico

  • Tema 12.3.1: Espectrometría de masas (MALDI-TOF) para la identificación microbiana rápida.

  • Tema 12.3.2: Introducción a la Secuenciación de Nueva Generación (NGS) en microbiología clínica.

  • Tema 12.3.3: Diagnóstico en el punto de atención (POCT) en microbiología.

• Capítulo 12.4: Epidemiología Microbiana y Salud Pública

  • Tema 12.4.1: El rol del laboratorio en la vigilancia de la resistencia antimicrobiana.

  • Tema 12.4.2: Investigación y control de brotes nosocomiales.

  • Tema 12.4.3: Patógenos emergentes y re-emergentes: preparación y respuesta del laboratorio.

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